2016年伊始，中國科學院人才交流開發中心新一輪組織機構調整拉開了帷幕。面對國家有關政策的調整、客戶需求的變化以及日益激烈的市場競爭等諸多嚴峻的挑戰，人才中心創新求變，果斷邁出了改革轉型的步伐。
此次改革是為了加快實現人才中心向現代人力資源開發轉變，鞏固傳統人事代理服務，大力發展人事外包業務，加強部門聯動合作，減少部門職能交叉與重疊，優化服務資源結構，提升整體服務品質。
本輪組織機構調整將原三里河分部、北郊分部統一并入人事代理部；新成立檔案管理部；撤銷了人才服務部，其學生接收業務劃歸人才招聘部，社保公積金業務劃歸人才派遣部；將行政管理和財務管理分開，成立綜合管理部、財務管理部。調整后的部門及其主要職能和負責人如下：
一、人事代理部（三里河分部、北郊分部）主要負責為用人單位提供人事代理與人事外包服務。主任范秀芳，副主任高會煥（主持三里河分部工作）、郭元（主持北郊分部工作）。
二、檔案管理部主要負責人事檔案管理、維護及檔案庫（電子化）建設與管理。主任楊向峰。
三、流動黨員管理部主要負責黨務管理、黨總支日常工作及流動黨員管理服務。主任張慶發。
四、人才派遣部主要負責人才派遣服務，同時為用人單位及個人提供社保、公積金代理服務。主任芮揚。
五、人才招聘部主要為用人單位和個人提供人才招聘、個人求職、學生接收以及人才培訓等服務。主任趙麗。
六、中高級人才部主要負責職稱評審、人才測評、人事咨詢、中高級人才尋訪、中高端培訓以及心理咨詢輔導等服務。主任湯忠杰。
七、綜合管理部主要負責公司內部人事管理、文書檔案、安全保衛、信息化建設以及對外協調宣傳等工作。副主任舒揚（主持工作）。
八、財務管理部主要負責財務管理、財務核算和財務支出等工作。副主任楊華（主持工作）。
